新冠病毒变异毒株Omicron是什么，它和德尔塔毒株有何异同？

Nature为大家简单介绍了《令科学家警惕的Omicron变异株》的现状，欢迎关注Nautre Portfolio专栏阅读更多。

研究人员正在努力明确这个快速传播的新冠病毒变异株是否会削弱新冠疫苗的效力。

南非的研究人员正在片刻不停地监视着一种新出现的新冠病毒（SARS-CoV-2）变异株的危险蔓延。这个变异株携带了在Delta等变异株中存在的大量突变，目前已在整个南非快速传开。

当务之急是在该变异株传播的同时对其进行更密切的监测：该毒株本月上旬首次在博茨瓦纳被发现，之后又在南非抵达香港的旅客中被发现。研究人员还想确定这个变异株的具体特性，比如它是否能逃逸疫苗诱导的免疫应答；又比如它引起的疾病比其他变异株的更轻还是更重。

“我们正在以超常速度工作。”南非约翰内斯堡的威特沃特斯兰德大学的病毒学家Penny Moore说。Moore的实验室正在测算该变异株有多大潜力能逃逸从疫苗和既往感染中获得的免疫力。传闻称已经出现了再感染病例和接种疫苗后的感染病例，但Moore表示，“目前阶段一切都还言之过早。”

“我们对这个变异株还有待认识。”南非德班的夸祖鲁·纳塔尔大学传染病内科医生Richard Lessells在南非卫生部11月25日组织的新闻发布会上说，“这个变异株的突变状况令人担忧，但我们现在要努力了解它的严重性，以及它对防疫措施的影响。”

11月26日，根据世卫组织（WHO）新冠病毒演化技术专家组的意见，世卫组织正式将这个代号B.1.1.529的毒株列为需关注的变异株，并取名Omicron。目前，Omicron和Delta、Alpha、Beta、Gamma都在世卫组织的需关注变异株清单上。

研究人员还想预测出该变异株传遍全球的潜力——这可能会引发新一轮的感染，或是加剧因Delta传播而居高不下的感染率。

刺突突变

研究人员在来自博茨瓦纳的基因组测序数据中发现了Omicron。之所以会被发现，是因为Omicron的刺突蛋白（能识别宿主细胞的新冠病毒蛋白，是机体免疫应答的主要目标）上有30多个突变，其中许多突变也存在于Delta和Alpha这类变异株中，这些突变与传染性增加以及能逃逸阻断感染的抗体有关。

南非豪登省是约翰内斯堡的所在地——Omicron在当地导致病例数激增也敲响了警钟。Lessells说，豪登省11月份的病例数增加得很快，尤其是在中小学生和青少年中。夸祖鲁·纳塔尔大学生物信息学家Tulio de Oliveira领导的一个团队开展的基因组测序和其他遗传分析发现，他们分析的11月12日至20日采集的豪登省77个病毒样本全部来自Omicron。目前团队正在对另外数百个样本进行分析。

Lessells说，Omicron的一个刺突蛋白突变能令其被基因型分析检测到——基因型分析出结果的速度要比基因组测序快很多。这些检测给出的初步证据显示，Omicron已经传到了豪登省以外很远的地方。Lessells说：“我们担心这个变异株可能已经在整个南非蔓延开来。”

疫苗效力

为了明确Omicron的威胁，研究人员将密切监测其在南非及其他地区的传播。此前，南非的研究人员曾快速调集兵力研究了2020末在当地发现的Beta变异株，同一批力量现在已经开始研究Omicron。

Moore的团队曾提供了关于Beta免疫逃逸能力的首批数据，目前已开始专攻Omicron。除了检测Omicron对其他免疫应答的逃逸能力，他们还打算检测Omicron逃逸能阻断感染的抗体的能力。Omicron在被抗体识别的刺突蛋白区域含有大量突变，这可能会削弱抗体的效力。Moore说， “我们已知的许多突变都还不确定，但还有很多突变看起来能引起进一步逃逸。” Moore说，计算机模拟还显示，Omicron或许能逃逸免疫系统中由T细胞产生的免疫力。她的团队希望能在两周内得到首批数据。

英国牛津大学研究病毒演化的Aris Katzourakis说：“一个迫切需要解答的问题是：既然Omicron有这么多突变，它会减弱疫苗的有效性吗？” Moore表示，南非当前使用的三种疫苗都出现了突破性感染，这些疫苗分别来自强生、辉瑞-BioNTech、牛津-阿斯利康。据新闻报道，香港两名对Omicron检测呈阳性的隔离旅客打的是辉瑞疫苗。一名旅客来自南非，另一名旅客则是在酒店隔离期间被感染的。

南非研究人员还将关注Omicron是否会比其他变异株导致更重或更轻的疾病，Lessells说， “真正关键的问题是疾病的严重程度。”

研究人员认为，Omicron对南非以外地区的威胁目前还说不准。Moore说，Omicron是否比Delta传播性更强的问题也不明确，因为当前南非的COVID-19感染人数很低。她说： “现在还算风平浪静。” Katzourakis认为，Delta流行率高的国家要重点关注Omicron出现的迹象。 “我们要观察这个变异株在竞争上有何优势，以及它的流行率是否会上升。”

原文以Heavily mutated Omicron variant puts scientists on alert为标题发表在2021年11月25日《自然》的新闻版块上

原文作者：Ewen Callaway

© nature

doi: 10.1038/d41586-021-03552-w

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今天欧美各大主流媒体都被一个爆炸性的新闻占据了头条，一个可怕的新冠变种在世界多地被发现。这个病毒超级变种，B.1.1.529，被发现之后仅仅三天，就被闪电命名为 Nu Variant （希腊字母 ν），中文读音是Niu，读来真的是一个“牛变种”

希腊字母表，我们已经用到了第十三个 Nu，而第十三又是一个最凶的数字，这个变种注定是个凶神

这个“牛变种”，的确如它的名字，各项能力都相当可怕。

这个“牛”变种，据信是在南非的艾滋病人群体中变异诞生的。因为疾病，这些人的免疫力低下，所以成为了天然的变异培养所。“牛”变种所携带的变异，大大超过了他的前辈。它跟德尔塔毒株的差异，比德尔塔与初代毒株的差异还要大。甚至有人戏称，不要叫它 “Nu变种”，而应该叫Covid-21，因为它跟原版病毒实在是已经面目全非。

这个“牛”变种已经集齐了32种主要变异，传播力爆表。当初的大魔王德尔塔，大概用了两个月才打翻前代贝塔变异株，而“牛变种”仅仅用了两个星期就把德尔塔打翻在地，让人目瞪口呆。

因为这个“牛”变种的突出蛋白所携带的变异实在太多，以至于专注于一种S蛋白突触设计的mRNA效力大幅下降。甚至之前迅速治好特朗普的神药“单抗”，据称也对变异的面目全非的病毒素手无策。

你看这密密麻麻的变异点位（上图），比德尔塔多了多少……

这么个怪物出现，世界各国纷纷停止南非往来航班，连躺平抗疫的英国都把南非拉进了黑名单，但是似乎为时已晚。

结合最近欧洲各国新增病例的快速反弹，很可能这个“牛”病毒已经在欧洲大陆开始传播了。

难怪欧洲各国哪怕民众出门打砸抢，“零元购”也要坚决第二次封城，看来是提前已经感受到了“牛”变种的威力。

连mRNA模范生以色列，也已经破防。

好在最近新面世的几款抗病毒药物，不依赖具体的突出蛋白，抗病毒效力相当广谱。不管是默沙东的Molnupiravir ，还是辉瑞的PAXLOVID 对新冠病毒不同毒株具有广谱杀灭作用。新冠是RNA病毒，RNA病毒复制自身的过程中需要一系列关键蛋白质酶，其中之一就是RNA聚合酶。这些抗病毒药的作用原理是抑制RNA病毒所依赖的RNA聚合酶，从而使RNA病毒无法复制。因此这个药并不会因为外壳几个突触的改变而丧失效用，对各种新冠变种都有很好的效果。

除了广谱之外，您看上边的分子式就知道，这个药是小分子化学药，也就是说可以通过化学合成的方式工业化大规模生产，口服小分子化学药，在廉价生产，有效分发，储存便利，使用方便等方面，具有压倒性的优势。

国产抗病毒药也箭在弦上。

希望这个“牛”变种，可以早日被降伏。不过“牛变种”来势如此汹汹，实在是让人心焦。

凌冬将至，你做好准备了吗？