英国发现的新冠病毒变种再次发生突变，影响如何？
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1.什么是E484K突变？它有什么特点？
在E484K突变中，带负电荷的氨基酸（谷氨酸）被带正电荷的氨基酸（赖氨酸）取代，结构分析表明，由于E484K突变，产生了一个新的ACE2结合位点。这可能使得ACE2和位于RBD的天然结合位点之间产生了明显更强的相互作用。
也就是说E484K突变会使得新冠病毒的传染性更强，同时多篇研究都指出E484K还会导致新冠病毒免疫逃逸能力。
这种突变型在南非B.1.351 / 501Y.V2和巴西B.1.1.28 / P1 / P2变体中都有发现，最让人头疼的是，E484K突变目前被认为是造成康复者血浆中的中和抗体，疫苗产生的抗体对新冠病毒失效/部分失效的主要原因。
比如现在上市的辉瑞和Moderna两种疫苗都对这个突变部分降低了保护力，而即将上市的Novavax重组蛋白疫苗对这种突变的保护力也从对一般病毒的90%以上降低到了60%左右。
2.英国目前情况如何？
上边是BBC的原文报道，其中提到英国本土的病毒毒株出现了E484K的突变，但是数量不多，对214,159个样本进行测序，只有11个带有E484K的突变。所以，英国目前本土这种突变很少，可能还没有巴西和南非的旅行者带过来的多。
3.E484K这种突变是怎么来的？
根据一篇对巴西的E484K病毒突变的研究论文中分析内容可以发现，[1]在巴西当地的多个亲缘关系较远的毒株中都发现了E484K突变的存在，他们认为这个更多的应该是平行进化造成的结果，也就是说在特定压力条件下，新冠病毒可能会定向的像E484K这个方向突变。
而这个特定压力，我猜测可能是早期临床的疫苗，也有可能是康复者的抗体血清。
就提高病毒适应性而言，E484K突变可能是不同病毒谱系的关键进化事件。
4.为什么E484K突变会在多国出现？
多国相继出现了E484K突变，有两种可能。
第一种，就是病毒重组（Recombination）。这是说某些不同的新冠病毒，在同时感染了一个细胞以后，在他们复制的过程中可能错误的组装了彼此的基因组导致的。比如巴西的的E484K突变病毒，随着人类宿主的活动，传播到了更多的地区，并与当地传播的毒株同时感染了一个宿主，并在复制过程中发生了重组现象，导致当地毒株也获得了这种突变。
第二种，就是平行进化（parallelism）。大概就是说虽然这些病毒本身没什么亲缘关系，但是在某些相似的外界压力下，都在向同一个方向（比如E484K）进化，或者说因为相似的外界压力，使得拥有E484K这种突变的病毒更容易传播和存活。这其实就是我以前提到过的，如果我们开始大规模的接种疫苗，就不得不面对的一种情况。
不管是哪种情况，都降使得病毒的进化方向朝着不利于我们疫情的防控的那头一路狂奔下去了。比如我们一直的几个比较头疼的新冠病毒突变，类似像K417N、E484K和N501Y这些。竟然在南非的501Y.V2的毒株上同时出现了。
简单的理解，因为世界各国疫情防控不力，导致一直病毒一直在全世界范围内流行，而且各地还有着交流，使得病毒也随之在不同地区交流。
这就跟养蛊一样，养到最后就会养出一种集百家之大成的强力突变毒株来，就比如501Y.V2这种，或者可能还有更强的也说不定。
所以疫情防控真的不是某个国家，甚至是某个地区的问题，而是一个全世界范围的问题，谁都没办法独善其身。哪怕你自己搞了个全民接种疫苗，当病毒从其他国家地区晃悠一圈学了新本领回来以后，这打过疫苗人群很有可能就跟原来裸奔的一样了。
参考
- ^E484K as an innovative phylogenetic event for viral evolution: Genomic analysis of the E484K spike mutation in SARS-CoV-2 lineages from Brazil https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.01.27.426895v1
英国发现带有E484K突变的新冠毒株，可能产生免疫逃逸，从而影响疫苗的效力。
可能有些朋友还有印象，去年9月份的时候，在英格兰东南部发现了一种被命名为VUI-202012/01的新冠变异毒株(属于新冠B.1.1.7家系)，基于研究人员发现，11月份的时候，伦敦诊断的新冠病例中还只有约26%感染了这种毒株，但到了12月份，伦敦就有超过60％的新发新冠病例都与这种新毒株有关。根据估算的病毒传播能力R值（在没有任何防疫管控时，一个感染者平均传染人数），新毒株的R值大概比初始病毒高了0.5左右（初始病毒R值约为3.5）。这种新毒株一共出现了17个位点的突变，其中被认为造成其传播性增高的，是其中一个发生在刺突S蛋白（Spike Protein）上的一个突变N501Y。然而值得注意的是，当时在这种毒株上并没有发现E484K这种突变。
那么E484K这种突变到底是何方神圣，可以让全球都这么紧张呢？
E484K这种突变第一次被报道是在南非发现的变异毒株上，该毒株被命名为 '501Y.V2'，该毒株的刺突S蛋白上，竟然一次出现了8个突变，而且在S蛋白上最关键的结合区域（receptor-binding domain:RBD），同时出现了3个突变—K417N、E484K和N501Y，这可能导致了该毒株传播性进一步升级，甚至比VUI-202012/01更强。
而根据随后一项实验室的研究数据结果，研究人员发现，E484K这个突变竟然极大的降低了新冠康复患者血清中新冠病毒抗体对其产生的中和能力！部分血清样本的中和能力降低了10倍以上，甚至还出现了无法中和病毒的血清样本。这其中的核心原因很有可能是E484K这个突变对病毒S蛋白的构象改变较大（我把这篇论文中的相关核心结果都放到一张图上了，有兴趣的朋友可以自己看看）[1]。
无独有偶，最近Novavax公布的的新冠疫苗数据，也显示其在英国的有效率高达89%，但在南非只有60%，两者差异显著，这也是第一次在真实的人群中验证了501Y.V2毒株的免疫逃脱属性。
而这次有所不同的是，E484K这种突变，在英国的B.1.1.7变异毒株中也被发现了！不过，在21万+份的病毒序列里，只发现了11份病毒带有这种变异，可以说频率很低[2]。但很明显，带有E484K突变的新冠毒株在南非，巴西等过已经开始流行起来了。只希望它们不要成为接下来全球流行的主要新冠毒株才好。
