El defensa fue traspasado al AS Roma con 18 años, ahí jugó únicamente 30 partidos antes de ser fichado por el Paris Saint Germain (PSG).

En septiembre de 2013 y con la camiseta número 5, Marquinhos debutó con el equipo parisino marcando un gol. Aunque juega como defensa central, Marquinhos suma 23 goles y 8 asistencias en los 278 partidos que ha jugado junto al PSG.

En 2016, Marquinhos fue convocado para los Juegos Olímpicos de Rio. Jugó como titular en los 6 partidos del torneo junto a Neymar, Gabigol y Gabriel Jesus. marcó uno de los penales que le dio la victoria a Brasil contra Alemania y que sería el primer oro para su país en futbol masculino.

Con la Selección absoluta de Brasil, Marquinhos ha disputado 46 partidos. Fue parte del conjunto que jugó en el Mundial FIFA de Rusia 2018 y del equipo campeón de la Copa América 2019. Junto a la “Canarinha”, el defensa viste la camiseta número 13.

Marquinhos ha declarado ser seguidor desde pequeño de Thiago Silva, con quien actualmente comparte equipo en el campo parisino.

Con el Paris Saint-Germain ha ganado 21 Copas en total; ha sido campeón de la Primera División francesa (Ligue 1), la Supercopa de Francia y la Coupe de la Ligue.

Es considerado uno de los mejores defensas de los últimos años con jugadas que lo han convertido en titular de su equipo actual y referente en el futbol mundial.