Zespoły nadnerczowo-płciowe są leczone, aby zrównoważyć ilość hormonów, jakie produkuje organizm. Lekarz może przepisać specyficzne leki – najczęściej tzw. glikokortykosteroidy, które pomagają kontrolować produkcję hormonów. Mogą to być pigułki lub zastrzyki, które trzeba brać codziennie. W niektórych przypadkach może być także konieczna operacja. W zależności od problemu, mogą być potrzebne również inne leki, jak na przykład pigułki antykoncepcyjne dla regulacji cyklu menstruacyjnego u kobiet. Wszystko to monitoruje lekarz.