MTR屯马线未来是在土瓜湾～何文田区间换向吗？

恐怕题主是看漏了路线图的细节。。。

看看这个：

土瓜湾站这里标示了“叠”这个字，因为这里使用了叠式站台设计（两个方向在不同楼层）。屯马线就是在这个站进行方向转换，南面为左侧通行，而北面则为右侧通行。两条路轨由始至终都是完全分离的。

另外在红磡站，当东铁线过海段通车之后，东铁线会使用现在屯马线新站台下方的新设站台（红磡站的新站台使用双层岛式设计）。留意图中有说明，屯马线在上层站台，而东铁线在下层站台：

同样，东铁线与屯马线并无共线行驶。而东铁线站台设于下方，是因为要减少从地面下降到地下，以及进入维多利亚港过海隧道的坡度。

的确是在土瓜湾站附近进行行车方向的改变。

但不是根据平交道岔来进行切换的，这样不能实现高密度行车，同时也很不安全；切换的方式是通过立体交叉的方式。屯马线与东铁线没有任何共线的区段（在原尖沙咀支线隧道入口重新修建了新的隧道入口将西铁线和马鞍山线直接连接）。此配线图中看似共线的地方全部都是立体相交