Juan V de Anhalt-Zerbst ( Dessau , 4 de septiembre de 1504 - Zerbst , 4 de febrero de 1551), fue un príncipe alemán de la Casa de Ascania y gobernante del principado de Anhalt-Dessau . A partir de 1544, asumió el gobierno del principado recreado de Anhalt-Zerbst .
Juan era el segundo hijo (pero el mayor superviviente) de Ernesto I, príncipe de Anhalt-Dessau , con su esposa Margarita , hija de Enrique I, duque de Münsterberg-Oels , y nieta de Jorge de Poděbrady , rey de Bohemia .
Tras la muerte de su padre en 1516, Juan y sus hermanos Jorge III y Joaquín I heredaron Anhalt-Dessau como co-gobernantes de acuerdo con la ley de familia de la Casa de Ascania. Durante sus primeros años de gobierno, su madre Margarete se desempeñó como regente.
Los hermanos compartieron el gobierno del principado durante casi veintiocho años, hasta 1544, cuando decidieron repartirse sus territorios. John recibió Zerbst , reviviendo así el antiguo principado de Anhalt-Zerbst que se extinguió en 1396 con la creación de Anhalt-Dessau y Anhalt-Köthen.
En Dessau , el 15 de febrero de 1534, Juan se casó con Margarita (n. 29 de septiembre de 1511 - m. después del 3 de diciembre de 1577), hija de Joaquín I Néstor, elector de Brandeburgo , y viuda de Jorge I, duque de Pomerania . El hijastro de Margarete, el nuevo duque de Pomerania, Felipe I , tuvo que pagarle una anualidad de por vida de 1200 florines de su tesoro personal para cubrir el costo de su dote.
De su matrimonio con Jorge I, Margarete tuvo una hija póstuma, Georgia, que siguió a su madre a Anhalt; sin embargo, se decidió que cuando cumpliera ocho años (en 1539) debía ser devuelta a Pomerania bajo la custodia de su medio hermano Felipe I. A pesar de esto, Margarita pudo haber mantenido a su hija con ella hasta mayo de 1543, cuando finalmente fue enviada a su tierra natal.