Joaquín Ernesto de Anhalt (21 de octubre de 1536 - 6 de diciembre de 1586), fue un príncipe alemán de la Casa de Ascania , gobernante del principado de Anhalt-Zerbst desde 1551 y desde 1570 único gobernante de todas las tierras de Anhalt .
Joachim Ernest nació en Dessau el 21 de octubre de 1536 como el segundo hijo de Juan V, príncipe de Anhalt-Zerbst , de su esposa Margaret , hija de Joachim I Nestor, elector de Brandeburgo . Recibió una amplia educación bajo la supervisión de su padre. El 1 de febrero de 1549, con apenas trece años, fue admitido oficialmente en la Universidad de Wittenberg , donde, entre otros, estudió con el teólogo Georg Helt .
En 1550, tras la muerte de su padre, heredó Anhalt-Zerbst junto con su hermano mayor Carlos I y su hermano menor Bernardo VII .
La muerte de su tío Jorge III sin herederos varones le permitió a él y a sus hermanos, Karl I y Bernhard VII, heredar Anhalt-Plötzkau en 1553, mientras que la muerte de su tío Joachim I le permitió a él y a su hermano sobreviviente Bernhard VII heredar Anhalt- Plötzkau. Dessau en 1561. En 1562 su primo Wolfgang abdicó Anhalt-Köthen a su favor.
En Barby , el 3 de marzo de 1560, Joachim Ernest se casó con Agnes (n. Barby , 23 de junio de 1540 - m. Bernburg , 27 de noviembre de 1569), hija de Wolfgang I, conde de Barby-Mühlingen . Tuvieron seis hijos.
En Stuttgart , el 9 de enero de 1571, Joachim Ernest se casó por segunda vez con Eleonore (n. Tübingen , 22 de marzo de 1552 - m. Schloss Lichtenberg , 12 de enero de 1618), hija de Christoph, duque de Württemberg . Tuvieron diez hijos.