Barnim gobernó durante un tiempo en común con su hermano mayor Jorge I; y después de la muerte de Jorge en 1531 compartió el ducado con su sobrino Felipe I, reteniendo para sí mismo el ducado de Pomerania-Stettin.

Los primeros años de su gobierno estuvieron entorpecidos por una disputa con el Margrave Joaquín I Néstor de Brandeburgo, quien quería anexionar Pomerania. En 1529, sin embargo, se firmó un tratado que liberaba a Pomerania de la supremacía de Brandeburgo con la condición de que si la familia ducal se extinguía el ducado sería integrado a Brandeburgo. Barnim adoptó las doctrinas de Martín Lutero, y se unió a la liga de Esmalcalda, pero no tomó parte en la subsiguiente guerra.

Pero como esta actitud dejó a Barnim sin partidarios fue obligado a someterse al emperador Carlos V, pagar una fuerte multa, y aceptar el Interim, emitido desde Augsburgo en mayo de 1548. También Johann von Falcken^[1]​ fue elegido Canciller porque su antigua noble familia estaba en contacto estrecho con Carlos V.

En 1569, Barnim entregó su ducado a su sobrino-nieto, Juan Federico, y murió en Stettin el 2 de junio de 1573.^[2]​

Barnim desposó a Ana de Brunswick-Luneburgo, una hija del Duque Enrique I de Luneburgo. El matrimonio produjo los siguientes hijos:

• María (1527-1554), desposó en 1544 al Conde Otón IV de Schauenburg-Pinneberg (1517-1576).
• Dorotea (1528-1558), desposó en 1554, al Conde Juan I de Mansfeld-Hinterort (m. 1567).
• Alejandra (1534-murió joven).
• Isabel (1537-1554).
• Ana (1531-1592), desposó en primeras nupcias en 1557 al Príncipe Carlos I de Anhalt-Zerbst (1534-1561), en segundas nupcias en 1566 al Burgrave Enrique VI de Plauen (1536-1572), y en terceras nupcias en 1576 al Conde Jobst II de Barby-Mühlingen (1544-1609).
• Sibila (1541-1564)
• Bogislao XII (c. 27 de agosto de 1542 - antes de 15 de septiembre de 1542).

• Anexo:Ducados y duques de Pomerania

•   Varios autores (1910-1911). «Barnim (dukes)». En Chisholm, Hugh, ed. Encyclopædia Britannica. A Dictionary of Arts, Sciences, Literature, and General information (en inglés) (11.ª edición). Encyclopædia Britannica, Inc.; actualmente en dominio público. 

• Gottfried von Bülow (1875), «Barnim XI., Herzog von Pommern», Allgemeine Deutsche Biographie (ADB) (en alemán) 2, Leipzig: Duncker & Humblot, pp. 79-82 .
• Ursula Scheil (1953). «Barnim IX.». Neue Deutsche Biographie (NDB) (en alemán) 1. Berlín: Duncker & Humblot. pp. 595-596. 
• Roderich Schmidt (1966). «Greifen». Neue Deutsche Biographie (NDB) (en alemán) 7. Berlín: Duncker & Humblot. p. 31.  (familia)