疾病暴发新闻

SARS-CoV-2水貂相关变异株——丹麦 - 大不列颠及北爱尔兰联合王国

2020年12月21日

形势概述

2020年12月14日,英国当局向世卫组织报告,通过病毒基因组测序确认了一种新的SARS-CoV-2变异株。这种变异株被称为SARS-CoV-2 VUI 202012/01(SARS-CoV-2正在调查的变异株,2020年,12月,变异株01)。

疫情描述

2020年12月14日,英国当局向世卫组织报告,通过病毒基因组测序确认了一种新的SARS-CoV-2变异株。这种变异株被称为SARS-CoV-2 VUI 202012/01(SARS-CoV-2正在调查的变异株,2020年,12月,变异株01)。初步分析表明,这种变异株可能更容易在人与人之间传播。正在进行调查,以确定这种变异株是否会导致症状严重程度、抗体反应或疫苗疗效的任何变化。

截至2020年12月13日,英国共发现1108例SARS-CoV-2 VUI 202012/01感染病例。这种变异株是在2020年12月英国东南部2019冠状病毒病(COVID-19)的病例意外增加后,作为流行病学和病毒学调查的一部分而被发现的。其特征是,从流行病学第41周到第50周(2020年10月5日至12月13日),14天病例报告率增加了三倍多。自大流行疫情开始以来,英国对平均5-10%的SARS-CoV-2病毒进行了常规测序,英格兰东南部对4%的此类病毒进行了常规测序。10月5日至12月13日,英国东南部超过50%的分离株被确认为变异株。回顾性分析发现,2020年9月20日,第一个被确认的变异体出现在英国东南部的肯特郡,随后,同类变异体在11月下旬迅速增加。确认存在这种变异株的大多数COVID-19病例都是在60岁以下的人群中发现的。

该变异株确定为存在氨基酸变化的一系列14个突变和三个缺失。其中一些突变可能会影响病毒的人间传播:

  • 确认的突变之一(N501Y)是改变受体结合域六个关键残基内的一个氨基酸。根据全球共享禽流感数据倡议数据库,包括南非(n=45)和澳大利亚(n=37)在内的几个国家已经分别报告了这种相同的受体结合域突变(N501Y)。测序分析显示,英国和南非报告的病毒N501Y突变各有其来源。
  • 在受体结合域发现了另一个具有生物学意义的突变,即P681H。
  • 最后,发现69/70位的缺失会影响采用S基因靶点的一些诊断性聚合酶链反应测定的性能。世界上大多数聚合酶链反应测定采用多个靶点,因此该变异体对诊断的影响预计不会很大。

新的VUI-202012/01变异株已在若干国家,包括澳大利亚、丹麦、意大利、冰岛和荷兰得到确认。

英国的初步报告显示,这种变异株比此前的流行病毒更容易传播,传播率估计增加了40%至70%(基本再生数R0增加了0.4,使其范围达到1.5至1.7)。实验室研究正在进行中,以确定这些变异病毒是否具有不同的生物学特性或可能改变疫苗疗效。目前没有足够的信息来确定这种变异株是否会导致临床疾病的严重程度、抗体反应或疫苗疗效的任何变化。

公共卫生应对

英国当局正在进行流行病学和病毒学调查,以进一步评估这种新的变异株的传播性、感染严重程度、再感染风险和抗体反应。由于其中一个突变(N501Y)位于受体结合域,当局正在紧急调查来自康复患者和接种疫苗患者对这种变异株的血清中和活性,以确定是否对疫苗性能有任何影响。

这种变异株的基因组数据已经由英国当局上传到全球共享禽流感数据倡议数据库,对该病毒的基因组监测继续在全国范围内进行,以监测局势。

2020年12月19日,英国当局宣布,受影响地区将升至四级限制,包括减少社交聚会、收紧行动限制、要求尽可能居家工作以及关闭非必要的经济活动。

世卫组织的风险评估

所有病毒,包括SARS-CoV-2,都会随着时间的推移而发生变化,但这些突变或变化大多不会直接有益于病毒,甚至可能妨碍其传播。需要进一步的实验室研究来更全面地了解特定突变对病毒特性以及诊断、治疗和疫苗的有效性的影响。这些调查很复杂,需要时间和不同研究小组之间的合作。

共享全基因组序列有助于合作伙伴进行深入分析。世卫组织SARS-CoV-2病毒演化工作组正在与来自英国的同事合作,以更好地解析现有结果并支持进一步研究。

为了解这些病毒在SARS-CoV-2临床表现、诊断、治疗和疫苗研发方面的影响,需要迅速开展更深入的流行病学和实验室研究。

世卫组织的建议

英国的初步发现提示了SARS-CoV-2病毒突变这一更广泛的问题,世卫组织强调了与其它国家和研究团队及时共享流行病学、病毒学和全基因组序列信息的重要性,包括通过全球共享禽流感数据倡议数据库等开源平台做到这一点。

世卫组织建议开展进一步的流行病学和病毒学研究,以了解英国和其它国家描述的特定突变,进而深入调查病毒在传染性和致病性方面的任何功能变化。世卫组织建议所有国家应尽可能增加对SARS-CoV-2病毒的常规测序,并在国际上共享序列数据,特别是要报告所发现的令人担忧的类似突变。

世卫组织希望提请注意,人们对报告的针对S基因的聚合酶链反应测定性能的损失表示关注。使用商业聚合酶链反应试剂盒的实验室,如果其靶向病毒基因在生产商的说明书中没有明确标识,建议联系生产商了解更多信息。针对病毒S基因进行内部聚合酶链反应测定的实验室也应该意识到这个潜在的问题。为了遏制对各国检测能力的影响,还建议在针对不同病毒基因的平行或多重测定中使用不同的测定方法,以识别潜在的变异株。

所有国家都需要评估其当地的传播水平,并采取适当的预防和控制措施,包括根据世卫组织的指导调整公共卫生和社会措施。

必须提醒社区和卫生工作者,为减少急性呼吸道感染的一般传播风险,需要遵守一些基本原则:

  • 避免与患有急性呼吸道感染的人密切接触;
  • 勤洗手,尤其是在与病人或其环境直接接触后;
  • 有急性呼吸道感染症状的人应注意咳嗽规矩(保持距离,用一次性纸巾或衣物遮挡咳嗽和打喷嚏处,并洗手);
  • 在卫生保健设施内,加强医院的标准感染预防和控制做法,尤其是在急诊科;
  • 适当佩戴口罩,并确保良好的通风。

世卫组织为所有旅行者推荐上述卫生措施,包括往返英国的旅行者。如果在旅行期间或之后出现急性呼吸道疾病症状,建议旅行者寻求医疗诊治,并向卫生保健提供者告知其旅行史。卫生当局应与旅行、运输和旅游部门合作,通过旅行健康诊所、旅行社、交通工具运营商和入境点向旅行者提供信息,以降低急性呼吸道感染的整体风险。

根据COVID-19突发事件委员会在最近一次会议上提出的建议,世卫组织建议缔约国应根据《国际卫生条例(2005)》第四十三条,定期重新审议适用于国际旅行的措施,并继续就明显干扰国际交通的措施向世卫组织提供相关信息和理由。各国还应确保干扰了国际交通的措施是基于风险、循证、连贯、适度和有时间限制的。

世卫组织最近发布了一份临时指南——“在COVID-19背景下执行基于风险的国际旅行方针的考虑因素”,为各国决策过程提供了基于风险的方针,以调整在国际旅行情况下与旅行相关的风险缓解措施,减少与旅行相关的SARS-CoV-2的输出、输入和传播,同时避免对国际交通的不必要干扰。

世卫组织建议各国采取基于风险的方针。鼓励国家当局公布其风险评估方法和适用限制措施的出境国清单,这些方法和清单应定期更新。在所有情况下,必要的旅行(例如,应急人员,公共卫生技术支持的提供者,运输和安全部门的关键人员如海员,遣返,以及食品、药品和燃料等必需品的货物运输)。

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