为什么Omicron 能取代Delta,而不是二者同时传染？

早在2020年，伦敦帝国理工学院的Robin J. Shattock就设计过一款基于原始株Spike序列的自复制mRNA疫苗。在今年1月14号该疫苗的临床1期数据已经公布，这也是关于自复制mRNA新冠疫苗在人体内最早的临床数据。然而，这款疫苗的1期临床数据并没有取得令人满意的结果，未能实现100%血清转化率。

2022年5月20号，Robin J. Shattock在BioRxiv上传文章：Omicron breakthrough infections in vaccinated or previously infected hamsters，他们发现感染Omicron或者感染Delta都无法为预防彼此的再度感染提供交叉保护力。通俗一点说，感染过Delta的人还可能再次感染Omicron，而感染过Omicron的人同样有再次感染Delta的风险。

他们用仓鼠接触感染模型来评估疫苗和既往感染对重新感染的保护效率。所谓仓鼠接触感染模型，就是用病毒直接感染供体仓鼠，然后把携带病毒的供体仓鼠和守卫仓鼠（接种疫苗或者先前感染过病毒）共同饲养，观察守卫仓鼠感染病毒的情况，分析血清抗体，病毒载量，体重变化等。

首先，他们发现接种2剂基于原始株Spike序列的自复制mRNA疫苗可以改善感染Delta后小鼠体重降低的程度，并且降低鼻甲中病毒载量，但是对于Omicron/BA.1的突破性感染没有任何效果。接种两剂自复制mRNA疫苗2周后，收集血清，发现与血清中靶向野生型/D614G的中和抗体滴度相比，靶向Delta的血清中和抗体滴度降低2倍，靶向Omicron的血清中和抗体滴度降低13倍。接种疫苗并且发生BA.1突破性感染的小鼠血清，对于BA.1/BA.2的中和抗体滴度仅仅比WT/Delta降低2.1/2.6倍。接种疫苗并且发生Delta突破性感染的小鼠血清对BA.1的中和抗体滴度要比野生型低6.7倍，而对BA.2的中和抗体滴度仅仅比野生型低2.2倍，这说明接种疫苗后，Delta突破性感染可能对BA.2提供交叉保护，而不是BA.1。

在仓鼠接触感染模型中，接着，他们发现BA.1能够逃脱以前感染过新冠早期变异株的小鼠体内的免疫保护力。感染WT/D614G或者Alpha能够为预防Omicron/BA.1的感染提供部分保护效果，但是，感染Delta无法提供对于Omicron/BA.1的预防保护效果。非常有意思的是，他们想进一步看看如果感染Omicron/BA.1是否可以预防再度感染Delta/BA.2呢？结果发现，在仓鼠接触感染模型中，感染Omicron/BA.1可以预防发生BA.2的再度感染，而无法预防Delta的再度感染。

最后，他们分析感染过各种新冠变异株的人群在症状开始显现后13-24天的血清中和抗体：首先，发现所有感染人群的血清对感染的同源型毒株的中和活性最高，而对于其他变异株的血清交叉中和能力总是低于同源型毒株的中和能力。其次，WT/D614G，Alpha或者Delta感染者血清对BA.1的中和能力是最低的。与血清对同源型毒株的中和能力相比，Delta感染者血清对于BA.1的中和能力显著下降120倍；WT/D614G感染者血清对于BA.1的中和能力显著下降128.5倍；Alpha感染者血清对于BA.1的中和能力显著下降60倍。最后，他们还发现，与血清对同源型毒株的中和能力相比，Omicron/BA.1感染者血清对于Delta的中和能力下降23倍，而对BA.2的中和能力下降15.3倍。以上数据说明Omicorn和早期新冠变异株的抗原表位距离以及BA.1和BA.2的抗原表位距离存在非常明显的差距。

此外，他们还发现发生突破性感染的疫苗接种人群要比只接种疫苗的人群产生的血清抗体滴度更高，展现出更加广谱的中和能力。当疫苗接种者发生Dela感染后血清对于BA.1/BA.2的中和抗体滴度仅仅比对Delta的中和抗体滴度降低3.5/3.7倍。让人很意外的是，感染BA.1的疫苗接种者血清对于BA.2的血清中和抗体滴度反而是最低的。

总结来说，通过这篇文章，我们可以得出这样的结论：如果只是感染BA.1或者只接种BA.1的特异性疫苗在未来非常容易感染Dleta或者从Delta衍生变异株。通过疫苗接种或者重复感染抗原表位差别非常大的变异株抗原或者毒株，会导致血清具有更加广谱的中和能力，这对于新冠mRNA多价疫苗的设计具有重要的参考意义。

BioFactory 留胡子的豆腐 出品

个人转载内容至朋友圈和群聊天，无需特别申请版权许可。

请相信：21世纪是生物的世纪，然而，这和你并没有太大的关系

纸上谈兵，偏见解读，偶尔瞎扯，欢迎指正。

根据新冠病毒序列数据库公布的结果，现在omicron毒株每日新增所占比例已经接近60%，delta每日新增的比例已经降低到40%以下。因此，有omicron正在取代delta的说法。

但这种生物学现象是群体数据的统计结果，哪个毒株能感染更多的病人，他在群体中的比较就更高。并不是说，一个病人感染delta后，又感染omicron，他体内就只有omicron。

题主混淆了群体和个体的区别，至于omicron能不能取代其它病毒的问题。比如将hiv和omicron每日新增的数据放在一起，肯定是omicron占绝大多数。但这不表示omicron能消灭hiv。