甲醛据我所知是起到灭活作用。就像原先狂苗生产就用甲醛灭活，目前国内通过地鼠肾细胞培养的狂犬病疫苗还是用甲醛灭活的，其他vero细胞生产狂苗的厂家都用β-丙内酯(BPL)。另外提供以下资料：
灭活是指破坏病原体的生物学特性，但尽可能避免影响其免疫原性或破坏血清中补体活性的过程。
常用的灭活剂有甲醛、β-丙内酯(BPL)或其他有效灭活剂。
甲醛是一种有强烈刺激性的致癌物质。其既可作用于病毒含氨基的核苷酸碱基（如A,G,U），又可作用病毒壳蛋白。作用于病毒壳蛋白时，易使蛋白质发生交联或病毒颗粒聚集，不能再作用于壳蛋白内的核酸。这样，病原体蛋白的抗原性会遭到严重破坏，并可能有病原体存活；用甲醛灭活时间长，一般需要在37-39℃处理24h以上或更长时间。并且灭活的效果易受温度、pH、浓度、是否存在有机物、病原体的种类和含氮量等因素影响，在研究中应引起注意；残留的游离甲醛，若随疫苗注入机体后，会产生制激性反应。
而β-丙内酯(BPL)在国外已广泛用于各种疫苗的灭活。它是一种杂环类化合物(C3H4O2)，沸点155℃，常温下是无色粘稠状液体，对病毒具有很强的灭活作用。作用机理：作用于病原体DNA或RNA，改变病毒核酸结构达到灭活目的，而不直接作用于蛋白。1. 特点：直接作用于病毒核酸，保持免疫原性，强灭活效果。β-丙内酯(BPL)直接与病毒核酸作用，而不作用于壳蛋白，不破坏病原体的免疫原性。2. 极易水解，无残留，并且水解产物无毒无害。大剂量β-丙内酯(BPL)虽是一种致癌物，但极易水解，在37℃水浴水解2h后消失，其水解为无毒性的人体脂肪代谢产物β-羟基丙酸 。另外，由于其能在疫苗液体中完全水解，不必考虑在成品疫苗中的残留。3. 灭活时间短，缩短了疫苗的生产周期。37℃仅需2小时β-丙内酯即可完全水解，灭活时间短，从而显著地缩短了疫苗生产周期，提高了经济效益。总之，β-丙内酯(BPL)作为疫苗灭活剂,可直接作用于核酸，对病毒的灭活能力很强；不破坏病毒的血凝素抗原, 保持病毒良好的免疫原性；其水解产物对机体无害，接种反应轻。故早在1984年就被选作狂犬灭活疫苗的灭活剂正式使用，现已被广泛应用于各种疫苗。
希望对大家有帮助另外；甲醛含有一个醛基，能和蛋白质的ε氨基交联，在免疫组化中就用它进行固定，严格上将它对蛋白质产生一定的变性作用，但是相对于其它SDS等离子性去污剂来说，其变性作用比较小，能够保留大部分抗原性。

甲醛灭活菌体后，应该产生两种免疫原：一类是天然的抗原，即未被甲醛破坏的抗原；另一类是被甲醛破坏后形成的新抗原。

这样想恐怕就不难理解。