壹、沿革：

    一、41年10月16日，由前陸軍第96軍軍部及所屬39師87師、212師調編而成立。

    二、本部成立之初，司令部下轄政治處、辦公室第一、二、三、四課、醫務所 勤務排等八單位。

    三、44年5月16日本部修改為乙種編制，官兵100員將原來「課」改為「科」，各 主管為中校科長，同年8月16日奉命成立「國民兵幹部隊」負責訓練甲種國民兵，於51年4月1日撤銷。

    四、45年7月1日奉令撤銷醫務所。

    五、51年4月1日本部奉令修訂為丙種團管區第一科撤銷。辦公室第二、三、四科改 為行政科動 員科、役政科、後勤科。52年5月1日役政科改為後備軍人管理科政治處改為政治作戰處。

    六、51年6月16日因任務需要編組，動員科增列召集股、役政股，後備軍人管理科增列編訓股、 管理股，於56年6月1日納入編制。58年10月16日召集、役政 編訓、管理奉令撤銷，增編 編訓科。並於同年11月1日由成功營區遷駐小東營 區(即現今臺南市網寮四分子)。

    七、65年2月16日奉令增編警備科8員執行轄區警備治安任務，同年4月1日司令編階 提昇為少將 編階，參謀主任、政戰主任均提高編階為上校。

    八、65年3月16日臺南師管區遷移高雄壽山本部進駐延平營區。

    九、82年11月3日長營營區房舍整建，暫遷八0二醫院臺南分院忠信營區辦公。

    十、85年1月1日原作戰科改為編訓科；同年6月26日長榮營區大樓整建完工本部進 駐辦公。

    十一、91年3月1日令頒後備司令部暨所屬各級單位編制裝備表(修正名稱後備司令部)，隸屬國防部並修訂所屬各單位銜稱。

    十二、95年3月1日改制為臺南市後備指揮部。

    十三、100年1月1日臺南縣市後備指揮部合併統稱為臺南市後備指揮部，駐地「長榮營區」。

           【本部隊史館導覽】