《安娜瑪德蓮娜》雖打正名號是一部愛情電影，但編劇岸西明顯地在幕後操控戲裡所表達的意識形態，或許這是受到前作《甜蜜蜜》橫跨時代歷史、國家地域的多角度多層次處理手法所影響，以致本片表面雖以交代出郭富城、陳慧琳及金城武三個角色的感情關係為主，但港人身份的辯證以至寄寓年青一代對前途的態度看法，也隱然從戲中透露出來。

此片始終是奚仲文首次執導的作品，個人表現只能做到偶有神采，如最後一章「變奏」，無論從角色形象到背景的教堂陳設都見美侖美奐，而這一節亦是本片的神來之筆，將陳慧琳金城武的幻想情節與張國榮袁詠儀的現實境況互相穿插，帶出現實的殘酷性，暗戀始終是暗戀，在現實生活中根本沒可能或鮮有可能把夢想化成真實。《安娜瑪德蓮娜》是同期寫情最出色香港電影之一，但某程度上過份架空人物的背景，去講述一個戀人的愛情故事，實感蕩然無存，這就比《甜蜜蜜》失色得多了。