1911年，辛亥革命爆发，作为封建专制象征的黄龙旗被革命者扔进了历史的垃圾堆，当时取而代之的是一面由红、黄、蓝、白、黑五色横长方条自上而下排列的五色旗。 [1] 五色旗本身是北洋海军的将领旗。“提督用五色长方旗；诸将用三色长方旗；旗之上角，各饰以锚形。如以后别国旗帜有同式者，由海军衙门酌改式样。” 1905年（光绪三十一年）7月，中国同盟会在日本东京成立。1906年冬，同盟会召集会议编撰《革命方略》。在讨论革命旗帜时，各路与会的成员提出了青天白日旗、十八星旗、五色旗、井字旗、金瓜钺斧旗等若干方案。 
1911上海纷纷挂起象征革命的五色旗12月28日，南京各省代表会议通电全国，确定12月29日选举临时大总统，号召“凡我国国民应于是日悬挂国旗以志庆典”，南京从29日起“一律悬挂五色国旗”。此时，临时大总统的选票上端就已经印上了两面五色旗交叉的图案。12月31日，沪军都督陈其美“出示晓谕”，“自1912年1月1日起各界一律悬挂国旗，以昭庆贺而光大典”。1912年1月1日，湖北军政府内务司要求本日“一律悬挂国旗”。 [1] 大元帅黄兴因孙中山曾在国旗上有过争论，迟疑不肯遽定。而上海各报已将有关消息披露了出去。黄兴道：“既经露布，用不着我核定，况国旗应由法律定之，只好待诸异日。”因此在没有孙中山参与之下，五色旗被定为临时国旗。 
以五色为主体的民国军徽1912年1月10日，临时参议院通过专门决议，使用五色旗作为临时国旗。同时通过的还有十八星旗为陆军旗。1913年（民国二年），青天白日满地红被定为海军旗。除了上述三种使用上较普遍的旗帜外，其他地区亦使用其他的旗帜。此时五色旗亦被用作海军舰艏旗。 1912年4月，临时政府北迁。5月4日，由南京迁北京的临时参议院召开第一次会议，“国旗案”被再次提出。由于临时政府建立时“前南京参议院议决用五色旗者，因各省几乎一致，故从多数”，至5月10日，“议长用五色旗为国旗之意询众议员，众议员全体起立表决，拍掌欢呼民国万岁”，五色旗率先获得全票通过。 [1]临时参议院认为“本院为全国立法机关，于国旗统一当然有议决之权”，议决以五色旗为国旗、十九星铁血旗为陆军旗、青天白日旗为海军旗。 
民国前期飞机徽
十二章国徽(1913.2-1928.12.29)1916年5月，在护国军讨伐袁世凯的战争中，孙中山对五色旗却有过一次妥协。为了团结各方面的力量，他指令：“云、贵、桂、浙均已一致遵用五色旗，吾党亦宜一律沿用，俾不致同讨贼之军而有猜疑。” 1921年5月，孙中山在广州就任临时大总统后，明令废止五色旗和铁血十九星旗，代之以青天白日旗。但当时广州政府影响力有限。1923年8月在广州举行全国学生联合会第五次评议会，会场上仍然悬挂着五色旗。孙中山对学生们道：“诸君应去弃满清之五色旗，举革命之青天白日旗。”
1924年9月，国民党通告：以青天白日满地红旗为国旗，青天白日旗为党旗、军旗。11月，孙中山乘悬挂青天白日满地红旗的“永丰”号兵舰离广州经香港北上，港英当局称：舰上改挂五色旗，方可按外交礼节接待。孙中山断然拒绝，宁可不在香港岛停留。这时，国际上承认的依然是五色旗。1925年3月，与五色旗斗了十几年的孙中山病逝于北京。
1926年北伐军兴，五色旗纷纷坠落。1928年新疆、热河纷纷易帜后，12月，张学良“东北易帜”。东北全境以几万幅青天白日满地红旗取代了五色旗。 五色旗作为临时国旗，曾经短短代表过国民政府一段历史，但马上被北洋政府、北洋军阀所利用。最后其中国国旗的地位于1928年（民国十七年）12月17日，国民党北伐成功后，被青天白日满地红旗取代。
在民国政府废除五色旗后，五色旗逐渐变成了抗日战争时期亲日政府的代表旗帜，伪政权伪满洲国旗和所谓的冀东防共自治政府、北平的中华民国临时政府（华北政务委员会前身）或南京的中华民国维新政府等伪政权都假借五色旗收买人心，各种旗帜就是由五色旗衍生设计。 [1] 
中间的旗帜是五色旗，下方写有共和万岁在北洋政府时期，采用五色旗的缘由，多是因为李鸿章的北洋派阀早在满清时期就使用五色旗，北洋陆师、北洋水师均不使用满清的黄龙旗而使用五色旗。而北洋政府多是北洋系的军人，所以使用五色旗不过是一种沿袭。
在清朝的北洋和新军所采用的五色军旗，又有代表五行一说，代表五方的颜色；又有五色代表仁，义，礼，智，信五德，然而这种说法没有具体的出处。尤其是白色代表智，对于汉语的惯用方法，有些牵强附会的感觉。
了解五色旗的含义的孙文，一直以来极力反对五色旗，孙文称五色旗——“此民国之不幸，皆由不吉之五色旗有以致之也。” [1]
民间使用的五色旗同盟会元老章太炎晚年，和国民政府对立，全力支持黎元洪、吴佩孚、孙传芳等北洋军阀。1936年，章太炎逝世之时，拒绝以青天白日旗覆盖，仍使用北洋政府的五色旗，以此表示对国民政府的抗议。 [1] 
五色旗孙中山还对五色旗进行了全面否定：“(一)清国旧例，海军以五色为一、二品大官之旗，今黜满清之国旗而用其官旗，未免失体。(二) 其用意为五大民族，然其分配代色取义不确，如以黄代满之类。(三)既言五族平等，而上下排列，仍有阶级。”
然而，为了争取袁世凯和满清北洋派系倒戈支持革命，参议院最终还是采用了满清北洋水师的五色旗为中华民国之国旗。1919年，孙中山在广州结成中国国民党，定青天白日旗为党旗，定青天白日满地红旗为国旗。1924年孙中山得到苏联支持，开始第一次国共合作，开设黄埔军校。1925年国民党和共产党共同成立广州政府，自此青天白日满地红旗为中华民国正式法定国旗，同时北洋政府使用五色旗为国旗。 [1] 
易帜
