1967年毛澤東的指示,開始批判《論共產黨員的修養》。5月8日,以《人民日報》、《紅旗》雜誌編輯部的名義,發表了長篇批判文章《〈修養〉的要害是背叛無產階級專政》。「希望各單位的革命同志,認真地組織學習和討論,進一步深入地開展對黨內最大的一小撮走資本主義道路當權派的大批判運動。
劉少奇開始被軟禁在北京家中。7月初,江青等指使北京建工學院群眾到中南海西門駐紮,建設高音喇叭,稱要把劉少奇從中南海就揪出來「鬥倒斗臭」,隨後北京高校上百個組織前往聲援,形成「揪劉火線」,圍困衝擊中南海,前後持續一個月。14日毛澤東離開北京,18日江青、康生、陳伯達組織批鬥劉少奇和王光美的大會,對其人身侮辱,逼迫其低頭彎腰兩個多小時並抄家。
1968年初後,劉少奇陸續患肺炎、糖尿病、高血壓、植物神經紊亂等疾病,3月以後病情加重。7月上旬,支氣管炎急性發作,轉為支氣管肺炎。7月24日搶救後脫離危險,但失去生活自理能力。10月9日後完全不能進食。
劉少奇兩次病危,經隨同醫護人員救治後脫險。11月6日,來自北京的醫護人員奉命返回。10日,劉少奇病情再次發作,當地醫務人員參照上兩次的辦法按肺炎治療。12日凌晨1時許,劉少奇出現異常症狀,值班護士仍按原處方用藥,6點38分發覺情況不妙,呼叫其他醫護人員。6點42分醫護人員到齊,6時45分劉少奇的心臟停止跳動,享年71歲。
1969年4月1日,中國共產黨第九次全國代表大會召開。九大正式會議上,中共中央副主席林彪代表中共中央作了政治報告。報告稱「無產階級文化大革命」「摧毀了以叛徒、內奸、工賊劉少奇為首的資產階級司令部,揭露了以劉少奇為總代表的黨內一小撮叛徒、特務、死不改悔的走資本主義道路的當權派,粉碎了他們復辟資本主義的陰謀」
劉少奇的屍體火化名單,姓名為「劉衛黃」、職業為「無業」