La nave Enterprise regresa a la Tierra como consecuencia de un controvertido incidente galáctico, con su intrépido capitán Kirk aún deseando volver a las estrellas en una misión de paz y exploración más larga. Pero no todo va bien en el Planeta Azul. Un devastador atentado terrorista ha puesto de manifiesto una alarmante realidad: la Flota Estelar está siendo atacada desde dentro.