調查官余正煌自訴前新竹市長林智堅涉侵害著作權。在台大國發所指導林智堅和余正煌論文的國安局長陳明通，今天透過委任律師陳昱龍發表聲明書以及105年2月1日林智堅研究計畫、105年3月8日余正煌研究計畫、105年7月21日余正煌碩士論文對照表。陳明通指余正煌民國105年3月8日寄給他的研究計畫以及最後的論文，在研究設計方面絕大部分皆來自林智堅當年2月1日論文計畫的內容，余正煌只是增加一點文獻檢討並引註。

陳明通在聲明指出，媒體今天報導余正煌委任律師表示，當初余正煌把論文初稿寄給他時，刪除引註部分，所以他寄給林智堅時，或許林智堅抄的時候沒有注意，才沒發現引註問題，可證林智堅抄襲事實非常明顯。「此等言論顯然與事實不符」。

陳明通說，他於105年1月5日以電子郵件寄送論文寫作底稿及格式給余正煌參考，檢視余正煌最近向法院所提證據：當年1月28日的論文進度，他發現在論文最核心的研究設計部分根本毫無進度，仍停留在1月5日他交付余正煌的論文寫作底稿階段。但同年2月1日林智堅的研究計畫，在他的指導下已完成雛形，從1月28日到2月1日，仍屬這個領域初學者的余正煌不可能在短短兩三天完成研究設計寫作，更沒有交付或email給他其論文最新進度，他更無從、無理由將余正煌的檔案寄給林智堅，「所謂林智堅抄襲余正煌論文完全不是事實」。