15 anni prima dell'inizio della storia, la terra viene attaccata da degli esseri robotici provenienti da un'altra dimensione, tramite dei portali chiamati "entrance": nonostante la facilità con cui gli eserciti di tutto il mondo vengono sconfitti, poco dopo i nemici tornano inspiegabilmente nella loro dimensione. A causa di un secondo attacco avvenuto sei mesi prima della vicenda, una minima parte della popolazione si rifugiò su delle isole artificiali, lasciandone però una grande parte indietro.
Kizuna Hida è uno studente appena iscrittosi all'accademia dell'isola artificiale Ataraxia, specializzata nell'addestramento militare tramite l'uso di equipaggiamenti speciali chiamati "Heart-Hybrid", in grado di generare armamenti quando il proprietario lo desidera. La direttrice dell'accademia è la sorella di Kizuna, Reiri, ed è stata lei stessa ad iscriverlo data l'importanza dell'abilità dell' Heart Hybrid di Kizuna: egli infatti può ricaricare l'energia di qualsiasi altra armatura semplicemente facendo eccitare sessualmente l'individuo con l'armatura scarica. Per questo verrà inserito nella "Amaterasu", la squadra più potente di Ataraxia, composta da tre studentesse molto popolari nell'ambiente accademico-militare: Aine, una misteriosa quanto bizzarra ragazza, molto vanitosa, sarà la prima ad entrare in contatto con Kizuna, Yurishia, considerata dall'accademia l'asso americano, e Hayuru, considerata l'asso del Giappone. Col passare del tempo, le tre studentesse costruiranno un rapporto sempre più intimo con Kizuna, aiutato ovviamente dalla sua abilità.